MathWorks Bioinformatics Toolbox

Программное обеспечение MathWorks Bioinformatics Toolbox представляет собой пакет расширения MATLAB содержащий набор функций и алгоритмов для обработки биологических данных, исследований в области биоинформатики, генной инженерии и в разработке лекарственных препаратов. Пакет MathWorks Bioinformatics Toolbox включает инструменты для выравнивания нуклеотидных последовательностей, редактирования белковых цепочек, инструменты для построения филогенетических деревьев различными методами.
Bioinformatics Toolbox осуществляет поддержку форматов представления генных и белковых данных, содержит специальные средства визуализации и анализа. Большинство функций написано на языке MATLAB, что позволяет, изменять существующие и создавать свои собственные алгоритмы.
Ключевые возможности
- Поддержка форматов данных генных и белковых цепочек (FASTA, PDB, SCF, Affymetrix DAT, GenePix GPR и др.).
- Доступ к биоинформационным базам через Интернет (GenBank, EMBL, NCBI BLAST, PDB и др.).
- Средства анализа белковых последовательностей.
- Средства построения и редактирования филогенетических деревьев.
- Анализа и визуализации микромассивов.
- Преобразование ДНК и РНК последовательностей в аминокислотные с использованием генетического кода.
- Визуализация специализированных графов.
- Анализ данных с масс-спектрометра.
Для работы пакета требуется:
- MATLAB.
- Не поддерживает Windows x64.